下出 信次 (シモデ シンジ)

SHIMODE Shinji

所属組織

大学院環境情報研究院 自然環境と情報部門

職名

教授

研究キーワード

カイアシ類、プランクトン、生物海洋学

ホームページ

http://www.mmcer.ynu.ac.jp/shimo/my_site/Welcome.html

関連SDGs




写真a

プロフィール 【 表示 / 非表示

  • https://www.researchgate.net/profile/Shinji_Shimode

学歴 【 表示 / 非表示

  •  
    -
    2002年3月

    京都大学   理学研究科   生物科学専攻   博士課程   修了

  •  
    -
    1998年3月

    横浜国立大学   教育学研究科   理科教育専攻   修士課程(博士前期課程)   修了

  •  
    -
    1996年3月

    横浜国立大学   教育学部   中学校教員養成課程   卒業

学位 【 表示 / 非表示

  • 博士(理学)

学内所属歴 【 表示 / 非表示

  • 2020年4月
    -
    現在

    専任   横浜国立大学   大学院環境情報研究院   自然環境と情報部門   教授  

  • 2012年4月
    -
    2020年3月

    専任   横浜国立大学   大学院環境情報研究院   自然環境と情報部門   准教授  

  • 2023年4月
    -
    現在

    併任   横浜国立大学   総合学術高等研究院   教授  

  • 2021年4月
    -
    現在

    併任   横浜国立大学   大学院環境情報研究院附属臨海環境センター   センター長  

  • 2021年4月
    -
    現在

    併任   横浜国立大学   大学院先進実践学環   教授  

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学外略歴 【 表示 / 非表示

  • 2011年4月
    -
    2012年3月

      東京大学   大学院新領域創成科学研究科   特任准教授

  • 2010年4月
    -
    2011年3月

      東京大学   大気海洋研究所   特任研究員

  • 2008年4月
    -
    2010年3月

      東京大学   海洋研究所   特任研究員

  • 2007年4月
    -
    2008年3月

      東京大学   海洋研究所   学術研究支援員

  • 2002年10月
    -
    2003年3月

      京都大学   教務補佐員

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著書 【 表示 / 非表示

  • 都市科学事典

    横浜国立大学都市科学部編( 担当: 分担執筆 ,  範囲: 6-3-10 人間活動の海底生態系への影響と 環境評価)

    春風社  2021年3月  ( ISBN:4861107342

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    総ページ数:1052   担当ページ:558-559   記述言語:日本語 著書種別:学術書

論文 【 表示 / 非表示

  • Empirical prediction model for egg production rate of a planktonic copepod, Calanus sinicus, estimated from reproductive index using formalin-preserved samples in Sagami Bay, Japan

    Shimode, S., T. Yamaguchi and K. Hidaka

    Plankton & Benthos Research   17 ( 3 )   301 - 311   2022年8月  [査読有り]

    DOI

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著  

  • Biological traits predict species' time-varying responses to multiple global change drivers

    Sasaki T., Iwachido Y., Lam-Gordillo O., Cook K., Douglas E., Gladstone-Gallagher R., Greenfield B. … 全著者表示

    Nature Communications   2026年3月  [査読有り]

    DOI

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   単著  

  • Interannual variability of pigment-based phytoplankton communities in the temperate coastal waters of Sagami Bay, Japan

    Yano, K; Ashenafi, RM; Takayama, Y; Shimode, S; Suzuki, K; Kuwahara, VS

    MARINE ECOLOGY PROGRESS SERIES   780   20 - 20   2026年3月  [査読有り]

    DOI Web of Science

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   共著  

  • Community and three-dimensional structures of microbial biofilms on submerged marine plastics in temperate coastal waters

    Sugai, Y; Hoshihara, AY; Fujiki, T; Ikuta, T; Yoshizawa, S; Shimode, S; Kuwahara, VS

    PLANKTON & BENTHOS RESEARCH   21 ( 1 )   52 - 62   2026年2月  [査読有り]

    DOI Web of Science CiNii Research

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:日本プランクトン学会、日本ベントス学会   共著  

    <p>To clarify the community compositions and three-dimensional (3D) structure of microbial biofilms on marine plastics, five types of plastic and glass plates were incubated in temperate coastal waters (Sagami Bay, Japan). Metabarcoding analysis showed that both prokaryotic and eukaryotic community structures on plastics and glass were largely different compared to ambient seawater, although similar communities were observed on different types of substrates except for polyethylene. Among the plastic-associated communities, Flavobacteriales (33.5–54.7%) were the most dominant prokaryotes, and microbial eukaryotes were dominated by Exogenida (suctorian ciliates) (74.5–80.3%), particularly the genus <i>Ephelota</i>, followed by Naviculales (pennate diatoms) (17.7–23.3%). Confocal fluorescence microscopy visualized the 3D layered structure of plastic biofilms mainly composed of bacteria and <i>Navicula</i>-like diatoms with the abundant and spatially heterogeneous distribution of the stalked suctorian ciliates. Bacteria and diatoms were found from the inner to outer layers of biofilms with abundant bacterial cells on the plastic surface, whereas the cell bodies of suctorian ciliates were observed exclusively in the outermost layer. Furthermore, chlorophyll autofluorescence was detected abundantly in the cell bodies of the ciliates, indicating their active grazing on diatoms. These combined taxonomic and structural results suggest the formation and developmental processes of microbial biofilms and biological interactions (synergistic and predatory relationships) on marine plastics. The present study indicates the proliferation of suctorian ciliates, which have been reported to cause serious damage to aquaculture, on plastics, implicating the potential ecological roles of marine plastic debris as a dispersal vector transporting harmful hitchhiking microorganisms.</p>

  • Optical water types associated with phytoplankton community structure in temperate coastal waters.

    Yano K., Ashenafi R.M., Chang B.A., Suzuki K., Shimode S. and Kuwahara V.S.

    The IEEE proceedings of OCEANS 2025 Great Lake   2025年11月  [査読有り]

    DOI

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)   単著  

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受賞 【 表示 / 非表示

  • 学生優秀発表賞

    2026年03月   日本海洋学会海洋生物研究会  

    受賞者:洲嵜大・下出信次・大場裕一・林昌平・金相曄・長塚さら沙・仲村康秀

  • 学生優秀発表賞

    2026年03月   日本海洋学会海洋生物研究会  

    受賞者:橋本陸人・髙山佳樹・下出信次

  • Early Career Ocean Professional (ECOP) Presentation Award

    2025年11月   北太平洋海洋科学機関  

    受賞者:橋本陸人・川野歩・髙山佳樹・下出信次

科研費(文科省・学振)獲得実績 【 表示 / 非表示

  • Ocean Hitchhikers: Remote Sensing Plastic Debris as Vector for Transport of Harmful Micro-organisms in Southeast Asia

    研究課題/領域番号:21KK0194  2021年10月 - 2025年3月

    国際共同研究強化(B)

その他競争的資金獲得・外部資金受入状況 【 表示 / 非表示

  • 相模湾と瀬底沖における浮遊性カイアシ類の産卵生態の地域間比較

    2023年4月 - 2024年3月

    琉球大学熱帯生物圏研究センター  2023年度共同利用・共同研究事業

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    担当区分:研究代表者

研究発表 【 表示 / 非表示

  • 海産浮遊性カラヌス目カイアシ類の雌性生殖腺の類型化と産卵戦略との関係の解明

    橋本陸人・髙山佳樹・下出信次

    海洋生物シンポジウム2026 

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    開催年月日: 2026年3月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  • 放散虫類・フェオダリア類(単細胞動物プランクトン)における生物発光:新知見と展望

    仲村康秀・下出信次・長塚さら沙・洲嵜大・岩本武尊・髙山佳樹・大場裕一

    海洋生物シンポジウム2026 

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    開催年月日: 2026年3月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

  • 放散虫類ホシツドイ目の系統関係と生物発光

    洲嵜大・下出信次・大場裕一・林昌平・金相曄・長塚さら沙・仲村康秀

    海洋生物シンポジウム2026 

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    開催年月日: 2026年3月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  • 相模湾におけるカジメEcklonia cavaの食害抑制条件下での生存率および成長量

    松本和真・高村正造・下出信次・髙山佳樹

    海洋生物シンポジウム2026 

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    開催年月日: 2026年3月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

  • 相模湾真鶴半島沖におけるニューストン性メソ動物プランクトン群集組成の季節変動

    栗原康紀・髙山佳樹・下出信次

    海洋生物シンポジウム2026 

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    開催年月日: 2026年3月

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(一般)  

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学会誌・論文誌編集等 【 表示 / 非表示

  • Plankton and Benthos Research

    副編集長 

    2019年4月
    -
    現在
     

  • 日本プランクトン学会報

    編集委員 

    2016年4月
    -
    2021月3日
     

  • Plankton and Benthos Research

    編集委員 

    2015年4月
    -
    2019月3日
     

共同・受託研究情報 【 表示 / 非表示

  • 文部科学省海洋資源利用促進技術開発プログラム「ハイパースペクトルカメラによるマイクロプラスチック自動分析手法の開発

    提供機関: 海洋研究開発機構  学内共同研究  

    研究期間: 2018年10月  -  2023年3月 

  • 共同研究契約

    提供機関: 国立研究開発法人水産研究・教育機構中央水産研究所  国内共同研究  

    研究期間: 2018年04月  -  現在 

  • 科研費新学術領域研究「海洋混合学の創設」公募研究「黒潮周辺海域におけるカイアシ類の分布・再生産速度と海洋混合との関係の解明」

    提供機関: 国立研究開発法人水産研究・教育機構中央水産研究所  国内共同研究  

    研究期間: 2018年04月  -  2020年3月 

  • 国立研究開発法人宇宙航空研究開発機構の地球環境変動観測ミッション(GCOM)「地球観測研究公募」

    提供機関: 創価大学  国内共同研究  

    研究期間: 2016年04月  -  現在 

 

担当授業科目(学内) 【 表示 / 非表示

  • 2026年度   沿岸海洋評価学演習

    大学院環境情報学府

  • 2026年度   沿岸海洋評価学

    大学院環境情報学府

  • 2026年度   統合的海洋管理学Ⅱ

    教養教育科目

  • 2026年度   統合的海洋管理学Ⅰ

    教養教育科目

  • 2026年度   生物の世界Ⅱ

    教養教育科目

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担当経験のある授業科目(学外) 【 表示 / 非表示

  • 自然環境科学特論C(2019年度)

    機関名:新潟大学理学部

 

委員歴 【 表示 / 非表示

  • 日本プランクトン学会

    2025年04月 - 現在  評議委員

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    委員区分:学協会 

  • 東京大学大気海洋研究所 共同研究運営委員会 学連携研究部会

    2025年04月 - 現在  運営委員

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    委員区分:その他 

  • 海洋都市横浜うみ協議会

    2023年04月 - 2025年3月  理事

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    委員区分:自治体 

  • 日本海洋学会「海洋生物学研究会」

    2022年10月 - 現在  運営委員

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    委員区分:学協会 

  • 日本プランクトン学会

    2022年10月 - 現在  論文賞選考委員

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    委員区分:学協会 

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社会活動(公開講座等) 【 表示 / 非表示

  • 大人向け臨海実習

    役割:講師, 企画, 運営参加・支援

    2023年11月

  • 令和5年度高校生授業等体験プログラム 横浜国大で学ぶ「地球科学」わくわく講座

    役割:講師

    2023年8月

  • 大人向け臨海実習

    役割:講師, 企画, 運営参加・支援

    2022年12月

  • 令和4年度高校生授業等体験プログラム 横浜国大で学ぶ「地球科学」わくわく講座

    役割:講師

    2022年8月

 

学内活動 【 表示 / 非表示

  • 2026年04月
    -
    現在
      統合的海洋管理学副専攻プログラム 教務委員   (全学委員会)

  • 2024年04月
    -
    2026年3月
      環境情報学府自然環境専攻長   (部局内委員会)

  • 2024年04月
    -
    2026年3月
      環境情報学府生命環境学専攻長   (部局内委員会)

  • 2012年04月
    -
    2021年3月
      環境情報研究院附属臨海環境センター運営委員   (部局内委員会)

  • 2000年04月
    -
    現在
      環境情報研究院附属臨海環境センター長   (部局内委員会)