研究者詳細 - 鈴木　市郎

Structural determination of the sheath-forming polysaccharide of Sphaerotilus montanus using thiopeptidoglycan lyase which recognizes the 1,4 linkage between alpha-D-GalN and beta-D-GlcA

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）共著

Kashiwabara Daisuke, Kondo Keiko, Usami Ryoji, Kan Daisuke, Kawamura Izuru, Kawasaki Yuta, Sato Mic … 全著者表示

INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES 183 992 - 1001 2021年7月 [査読有り]

DOI Web of Science PubMed CiNii Research

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Elsevier 共著

Sphaerotilus natans is a filamentous sheath-forming bacterium commonly found in activated sludge. Its sheath is assembled from a thiolic glycoconjugate called thiopeptidoglycan. S. montanus ATCC-BAA-2725 is a sheath forming member of stream biofilms, and its sheath is morphologically similar to that of S. natans. However, it exhibits heat susceptibility, which distinguishes it from the S. natans sheath. In this study, chemical composition and solid-state NMR analyses suggest that the S. montanus sheath is free of cysteine, indicating that disulfide linkage is not mandatory for sheath formation. The S. montanus sheath was successfully solubilized by N-acetylation, allowing solution-state NMR analysis to determine the sugar sequence. The sheath was susceptible to thiopeptidoglycan lyase prepared from the thiopeptidoglycan-assimilating bacterium, Paenibacillus koleovorans. The reducing ends of the enzymatic digests were labeled with 4-aminobenzoic acid ethyl ester, followed by HPLC. Two derivatives were detected, and their structures were determined. We found that the sheath has no peptides and is assembled as follows: [-+4)-beta-D-GlcA-(1-+4)-beta-D-Glc-(1-+3)-beta-D-GalNAc-(1-+4)-alpha-D-GalNAc-(1-+4)-alpha-D-GalN-(1-+]n (beta-D-Glc and alpha-D-GalNAc are stoichiometrically and substoichiometrically 3-O-acetylated, respectively). Thiopeptidoglycan lyase was thus confirmed to cleave the 1,4 linkage between alpha-D-GalN and beta-D-GlcA, regardless of the peptide moiety. Furthermore, vital fluorescent staining of the sheath demonstrated that elongation takes place at the tips, as with the S. natans sheath. (c) 2021 Elsevier B.V. All rights reserved.

Aggregability of β(1→4)-linked glucosaminoglucan originating from a sulfur-oxidizing bacterium Thiothrix nivea

Minoru Takeda, Keiko Kondo, Ryo Tominaga, Honomi Mori, Mana Kato, Ryoji Usami, Tomoi Murakami, Kazu … 全著者表示

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 84 ( 10 ) 2085 - 2095 2020年10月 [査読有り]

Aggregability of β(1→4)-linked glucosaminoglucan originating from a sulfur-oxidizing bacteriumThiothrix nivea

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）共著

Takeda Minoru, Kondo Keiko, Tominaga Ryo, Mori Honomi, Kato Mana, Usami Ryoji, Murakami Tomoi, Ueda … 全著者表示

Bioscience, biotechnology, and biochemistry 84 ( 10 ) 2085 - 2095 2020年6月

CiNii Research

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Oxford University Press 共著

beta-1,4-glucosaminoglucan (GG) was prepared from the sheath of a sulfur-oxidizing bacteriumThiothrix nivea. Recently, GG was found to be adsorbed by cellulose (paper) and is therefore potentially applicable as an aminating agent for cellulose. We attempted to increase the yield of GG using a fed-batch cultivation method. Furthermore, the behavior of GG molecules in water was theoretically and experimentally investigated. NMR analysis in combination with molecular dynamics calculation suggested that GG molecules tend to form soluble aggregates in water. It was experimentally revealed that the self-aggregation is enhanced by the addition of NaCl and reduced temperature. Adsorption of GG onto cellulose via hydrogen bonding was confirmed by molecular dynamics simulation. Adsorption was also promoted in the presence of NaCl but was inhibited by a reduction in temperature. Only 11% of the amino groups in the GG-treated paper was reactive, suggesting that GG molecules adsorbed by the paper were forming aggregates.

Effect of elevated temperature on cis-1,2-dichloroethene dechlorination and microbial community structure in contaminated soils—A biostimulation approach

Yuji Yamazaki, Ai Hasegawa, Xiaowei Tian, Ichiro Suzuki, Takeshi Kobayashi, Takaaki Shimizu, Daisuk … 全著者表示

Journal of Environmental Chemical Engineering Vol.8 ( 2 ) 2020年1月 [査読有り]

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：ELSEVIER 共著

その他リンク： https://doi.org/10.1016/j.jece.2020.103682

DNA解析からのゴチュジャン膨れ事故原因解明

白至桓, 鈴木市郎, 武田穣, 小泉淳一

生物工学会誌 97 ( 5 ) 246 - 252 2019年3月

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：公益社団法人日本生物工学会共著

その他リンク： https://www.sbj.or.jp/wp-content/uploads/file/sbj/9705/9705_hobun.pdf

Formation of Gold Particles via Thiol Groups on Glycoconjugates Comprising the Sheath Skeleton of Leptothrix

Tatsuki Kunoh, Yoshihiro Kusano, Minoru Takeda, Makoto Nakanishi, Syuji Matsumoto, Ichiro Suzuki, M … 全著者表示

Geomicrobiology Journal 36 ( 3 ) 251 - 260 2019年1月 [査読有り]

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）共著

Identification and characterization of the S-layer formed on the sheath of Thiothrix nivea.

Kawasaki, Y., Kurosaki, K., Kan, D., Borges, I. K., Atagui, A. S., Sato, M., Kondo K., Katahira M., … 全著者表示

Archives of Microbiology 200 ( 8 ) 1257 - 1265 2018年10月 [査読有り]

Causative microorganisms on swelling incident of Gochujang.

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：SPRINGER 共著

Back, J.H., Suzuki, I., Takeda, M., Koizumi, J.

Japan Journal of Food Engineering 19 ( 2 ) 105 - 110 2018年6月 [査読有り]

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Japan Society for Food Engineering 共著

その他リンク： https://www.jstage.jst.go.jp/article/jsfe/19/2/19_17513/_article

Enzymatic degradation of β-1,4-linked N-acetylglucosaminoglucan prepared from Thiothrix nivea

Minoru Takeda,Keiko Kondo,Shuhei Sanda,Daisuke Kan, Isabele Kazahaya Borges, Ichiro Suzuki, Masato … 全著者表示

International Journal of Biological Macromolecules 109 323 - 328 2018年4月 [査読有り]

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Elsevier 共著

Green Synthesis of Gold Nanoparticles Coupled with Nucleic Acid Oxidation

Tatsuki Kunoh Minoru Takeda, Syuji Matsumoto, Ichiro Suzuki, Mikio Takano, Hitoshi Kunoh,Jun Takada

ACS Sustainable Chem. Eng. 6 ( 1 ) 364 - 373 2017年10月 [査読有り]

Quantification of Chloroflexi Eikelboom morphotype 1851 for prediction and control of bulking events in municipal activated sludge plants in Japan

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：ACS Publications 共著

Tadashi Nittami, Lachlan B. M. Speirs, Takuya Yamada, Ichiro Suzuki, Junji Fukuda, Futoshi Kurisu, … 全著者表示

Applied Microbiology and Biotechnology 101 ( 9 ) 3861 - 3869 2017年1月 [査読有り]

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Springer Berlin Heidelberg 共著

その他リンク： http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00253-016-8077-4

An enantioselective NADP + -dependent alcohol dehydrogenase responsible for cooxidative production of (3S)-5-hydroxy-3-methyl-pentanoic acid

Minoru Takeda, Aline Tiemi Matsumura, Kaishi Kurosaki, Rajan Thapa Chhetri, Shigekazu Motomatsu, Ic … 全著者表示

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 80 ( 6 ) 1155 - 1163 2016年2月 [査読有り]

Bacterial diversity in biological filtration system for the simlutaneous removal of arsenic, iron and manganese from groundwater.

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：日本農芸化学会共著

汎用型ミニスラブゲル電気泳動装置による土壌微生物群集の変性剤密度勾配ゲル電気泳動(DGGE)解析.

加藤孝太郎, 鈴木市郎, 豊田剛己, 田渕浩康

農業・環境・健康研究所報告 2 37 - 43 2015年3月

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（大学，研究機関紀要）出版者・発行元：(公財)農業・環境・健康研究所共著

生物ろ過によるFe・Mn除去　～しくみ、浄化にかかわる微生物～

鈴木市郎

第10回地下水利用技術セミナー講演集 57 - 62 2014年8月 [招待有り]

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（研究会，シンポジウム資料等）出版者・発行元：NPO法人地下水利用技術センター単著

Rajan Thapa Chhetri, Ichiro Suzuki, Takuya Fujita, Minoru Takeda, Jun-ichi Koizumi, Yoko Fujikawa, … 全著者表示

Journal of Water and Environment Technology 12 ( 2 ) 135 - 149 2014年4月 [査読有り]

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：日本水環境学会共著

その他リンク： https://www.jstage.jst.go.jp/article/jwet/12/2/12_135/_article

Bacterial diversity in biological filtration plant for the removal of iron and manganese from groundwater

Rajan THAPA CHHETRI, Ichiro SUZUKI, Jun TAKEZAKI, Hiromitsu TABUSA, Minoru TAKEDA, Jun-ichi KOIZUMI

Journal of Water and Environment Technology 11 ( 1 ) 33 - 47 2013年2月 [査読有り]

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）共著

Identification and characterization of a Mycobacterial (2R,3R)-2,3-butanediol dehydrogenase.

Minoru Takeda, Takahiro Muranushi, Sawako Inagaki, Takuya Nakao, Shigekazu Motomatsu, Ichiro Suzuki … 全著者表示

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 75 ( 12 ) 2384 - 2389 2011年12月 [査読有り]

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）共著

Comparison of arsenate, lead, and cadmium adsorption onto aged biofilter media.

Danladi Mahuta Sahabi, Minoru Takeda, Ichiro Suzuki, Jun-ichi Koizumi

Journal of Environmental Engineering 136 ( 5 ) 493 - 500 2010年10月 [査読有り]

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：ASCE-AMER SOC CIVIL ENGINEERS 共著

Effect of culture conditions on manganese oxidation of microbial consortia from biological filter media.

Rajan Thapa Chhetri, Danladi Mahuta Sahabi, Ichiro Suzuki, Jun-ichi Koizumi

13th International Symposium on Microbial Ecology PS.06.105 2010年8月 [査読有り]

記述言語：英語掲載種別：研究論文（国際会議プロシーディングス）共著

Numerical analysis for evaluation of bacterial diversity by PCR-denaturing gradient gel electrophoresis using intensity information of gel images.

Ichiro Suzuki, Yusuke Iguchi, Jun-ichi Koizumi

13th International Symposium on Microbial Ecology PS.06.102 2010年8月 [査読有り]

記述言語：英語掲載種別：研究論文（国際会議プロシーディングス）共著

Adsorption and abiotic oxidation of arsenic by aged biofilter media: Equilibrium and kinetics.

Danladi Mahuta Sahabi, Minoru Takeda, Ichiro Suzuki, Jun-ichi Koizumi

Journal of Hazardous Materials 168 ( 2-3 ) 1310 - 1318 2009年9月 [査読有り]

Prosthecobacter fluviatilis sp. nov., which lacks the bacterial tubulin btubA and btubB genes

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）共著

地下水中のFe・Mnを除去するバイオフィルトレーションにおける細菌群集構造と浄化の機構

Danladi Mahuta Sahabi、鈴木市郎、佐藤継久、笠井翔太、武田穣、小泉淳一

第43回日本水環境学会年会講演集 544 2009年3月

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）共著

銅合金復水器管「異常潰食」発生メカニズムの解明：その３マンガンに富む付着物の人工再現並びに総合考察.

川辺允志, 鈴木市郎, 山本直哉, 濱田稔

火力原子力発電 60 ( 3 ) 263 - 267 2009年3月 [査読有り]

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（学術雑誌）共著

Removal of Mn2+ from water by "aged" biofilter media: The role of catalitic oxides layers.

Danladi Mahuta Sahabi, Minoru Takeda, Ichiro Suzuki, Jun-ichi Koizumi

Journal of Bioscience and Bioengineering 107 ( 2 ) 151 - 157 2009年2月 [査読有り]

Web of Science

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）共著

銅合金復水器管「異常潰食」発生メカニズムの解明：その2 マンガン酸化細菌の同定と酸化能.

川辺允志, 鈴木市郎, 山本直哉, 濱田稔

火力原子力発電 60 ( 2 ) 160 - 168 2009年2月 [査読有り]

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（学術雑誌）共著

銅合金復水器管「異常潰食」発生メカニズムの解明：その１　経緯ならびに富マンガンスケールの解明.

川辺允志, 鈴木市郎, 山本直哉, 濱田稔

火力原子力発電 60 ( 1 ) 59 - 66 2009年1月 [査読有り]

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（学術雑誌）共著

生物ろ過による地下水のFe・Mn除去におけるLeptothrix属近縁細菌群の特異的検出

佐藤継久、笠井翔太、鈴木市郎、村山壮史、武田穣、小泉淳一

第24回日本微生物生態学会講演要旨集 24 78 2008年11月

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）出版者・発行元：日本微生物生態学会共著

Bacterial consortium in groundwater treatment plant for simulutaneous removal of As, Fe and Mn using biological filtration.

Rajan Thapa Chhetri、鈴木市郎、藤田卓也、武田穣、小泉淳一

第24回日本微生物生態学会講演要旨集 130 2008年11月

記述言語：英語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）共著

微生物群集構造解析における標準的なPCR-DGGE法の検討

内田浄一、鈴木市郎、小泉淳一

第24回日本微生物生態学会講演要旨集 87 2008年11月

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）共著

微生物群集構造の解析法としてのDGGE法の実験条件の整理とRFLP法との比較

井口裕介、鈴木市郎、小泉淳一

第60回日本生物工学会大会講演要旨集 210 2008年8月

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）出版者・発行元：日本生物工学会共著

Professional Science Master's: 「理数系のMBA」にみる米国の産学連携教育

鈴木市郎

第60回日本生物工学会大会講演要旨集 45 2008年8月 [招待有り]

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）単著

微生物群集による鉄・マンガンを含む地下水の上水処理と、ヒ素除去への応用

鈴木市郎

第60回日本生物工学会大会講演要旨集 37 2008年8月 [招待有り]

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）単著

Sphaerotilus natansの鞘形成に関与する遺伝子の解析

小川ひとみ、柏原大輔、小泉淳一、武田穣、鎌形洋一

第60回日本生物工学会大会講演要旨集 199 2008年8月

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）出版者・発行元：日本生物工学会共著

生物ろ過による鉄・マンガンを含む地下水の上水処理における微生物群集の組成

佐藤継久、笠井翔太、鈴木市郎、武田穣、小泉淳一

第60回日本生物工学会大会講演要旨集 210 2008年8月

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）出版者・発行元：日本生物工学会共著

Minoru Takeda, Akiko Yoneya, Yuichi Miyazaki, Keiko Kondo, Hiroko Makita, Masashi Kondoh, Ichiro Su … 全著者表示

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 58 ( 7 ) 1561 - 1565 2008年7月 [査読有り]

記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）単著

ヒ素を含む地下水の生物ろ過による浄化における微生物群集の構造

ラジャン　タパ・チェットリ、笹田良、小泉淳一、藤川陽子、殿界和夫、谷外司、南淳志、濱崎竜英、菅原正孝

第42回日本水環境学会年会講演集 574 2008年3月

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）共著

Bacterial diversity in biological filtration system for simultaneous removal of As, Fe, and Mn in groundwater

Rajan THAPA CHHETRI, Ryo SASADA, Ichiro SUZUKI, Jun-ichi KOIZUMI

第23回日本微生物生態学会大会講演要旨集 154 2007年9月

記述言語：英語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）共著

Professional Science Masters;米国におけるビジネスを志向した理数系大学院教育

鈴木市郎

第59回日本生物工学会大会講演要旨集 17 2007年9月 [招待有り]

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）単著

水圏由来のマンガン酸化細菌

鈴木市郎

2007年電気化学会講演要旨集 97 2007年9月 [招待有り]

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）単著

沿岸海域より分離されたマンガン酸化細菌

鈴木市郎、山本直哉、川辺允志

第23回日本微生物生態学会講演要旨集 83 2007年9月

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）共著

生物ろ過による鉄・マンガンを含む地下水の浄水処理における微生物群集の組成

佐藤継久、竹崎潤、鈴木市郎、笠井翔太、武田穣、小泉淳一

第23回日本微生物生態学会大会講演要旨集 153 2007年9月

記述言語：日本語掲載種別：研究論文（その他学術会議資料等）共著

Bacterial diversity in biological treatment plant for removal of iron and manganese from groundwater.

Ichiro Suzuki, Jun Takezaki, Hiroki Kusumoto, Hiroko Makita, Minoru Takeda, Jun-ichi Koizumi

11th International Symposium on Microbial Ecology A77 2006年8月 [査読有り]

記述言語：英語掲載種別：研究論文（国際会議プロシーディングス）共著

Paenibacillus hodogayensis sp. nov., capable of degrading the polysaccharide produced by Sphaerotilus natans.

Takeda, M., Suzuki, I, Koizumi, J.-I.

Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 55 ( 2 ) 737 - 741 2005年 [査読有り]