研究経歴 【 表示 ／ 非表示 】

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• 低分子化合物ライブラリーを用いたフッ素NMRスクリーニング

  受託研究  

  研究期間：

• 創薬等ライフサイエンス研究のための相関構造解析プラットフォームによる支援と高度化（創薬基盤NMR技術の開発）

  その他の研究制度  

  研究期間：

• NMR分子置換法の開発

  科学研究費補助金  

  研究期間：

• データベースを利用したNMR創薬支援パイプラインの開発

  科学研究費補助金  

  研究期間：

• 病原体による宿主脂質ハイジャック機序の解明と創薬への応用（タンパク質-脂質間の物理的相互作用解析手法の改良・開発とLTPへの適用）

  ＪＳＴ戦略的創造研究推進制度（研究チーム型）　（戦略的基礎研究推進事業：ＣＲＥＳＴ）  

  研究期間：

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著書 【 表示 ／ 非表示 】

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• タンパク質の構造解析手法とIn silicoスクリーニングへの応用事例 ～AlphaFold、In silico創薬、NMR、X線、クライオ電子顕微鏡～

  執筆者：62名（著・文・その他）、技術情報協会（編）（ 担当： 分担執筆 ,  範囲: 第1章第１節「溶液NMRの手法を用いたタンパク質の立体構造解析」、第1章第2節「溶液NMRの測定条件設定と試料前処理」）

  技術情報協会  2023年7月  （ ISBN:978-4861049712 ）

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  総ページ数：530   担当ページ：3-10、11-17   記述言語：日本語 著書種別：学術書

• 創薬研究のための相互作用解析パーフェクト（実験医学別冊）

  津本浩平(編)，前仲勝実(編), 古板恭子, 児嶋長次郎, 児玉高志, 他（ 担当： 分担執筆 ,  範囲: 第1章「フラグメント創薬(FBDD)のための溶液NMR実験法（Ⅰ-8）」「水素-重水素交換質量分析(HDX-MS)実験法による相互作用部位の解析（Ⅱ-15）」）

  羊土社  2021年12月  （ ISBN:978-4-7581-2256-6 ）

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  総ページ数：368   担当ページ：86-98、160-167   記述言語：日本語 著書種別：学術書

学位論文 【 表示 ／ 非表示 】

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• Precise structure determination of a DNA oligomer by NMR

  児嶋長次郎

  1995年3月

  学位論文（博士）   単著  

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  大阪大学理学研究科無機及び物理化学専攻
  DNAオリゴマーのNMR精密構造解析法の開発。

• NMRを用いた核酸オリゴマーUASGの構造と運動性の解析

  児嶋長次郎

  1992年3月

  学位論文（修士）   単著  

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  大阪大学理学研究科無機及び物理化学専攻
  GAL4蛋白質が結合するDNA配列UASGのNMR構造解析および運動性解析。

論文 【 表示 ／ 非表示 】

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• NMR determination of the 2:1 binding complex of naphthyridine carbamate dimer (NCD) and CGG/CGG triad in double-stranded DNA

  Shuhei Sakurabayashi, Kyoko Furuita, Takeshi Yamada, Noriaki Sugiura, Makoto Nomura, Takanori Nakan … 全著者表示

  Journal of the American Chemical Society   147 ( 17 )   14254 - 14269   2025年4月  [査読有り]

  DOI

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  担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   共著  

  Small molecules that bind to mismatched DNA have been applied in various fields, including nanotechnology, bioimaging, and therapeutics. However, the intrinsic dynamic nature of mismatched DNA complicates the prediction of structural changes upon ligand binding, hindering rational ligand design. In this study, NMR was used for structure-based drug design, with a focus on the G:G mismatch binder ND and the structural dynamics of the DNA-ND complex. Through comprehensive NMR analysis with isotope labeling, two complex structures, the transient and stable complexes, were successfully determined. The nucleobase flip-outs and the distortion of the phosphate backbone of the complex structures were characterized by residual dipolar coupling (RDC) and 31P NMR, respectively. The RDC-refined stable complex structure suggested that the ligand linker–nucleobase interaction allosterically regulates a structural transition. This interaction was experimentally validated by 1H–15N HSQC spectra using a 15N-labeled ligand. Disruption of this key allosteric interaction facilitated the design of a new ligand, sND, that traps the transient complex structure. In conclusion, comprehensive NMR analysis using a weak binder aids in designing nucleic acid-binding ligands based on transient complex structures.

  その他リンク： https://doi.org/10.1021/jacs.4c17538

• An NLR paralog Pit2 generated from tandem duplication of <i>Pit1</i> fine-tunes Pit1 localization and function

  Li, YY; Wang, Q; Jia, HM; Ishikawa, K; Kosami, K; Ueba, T; Tsujimoto, A; Yamanaka, M; Yabumoto, Y; … 全著者表示

  NATURE COMMUNICATIONS   15 ( 1 )   2024年5月  [査読有り]

  DOI Web of Science PubMed

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  記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   共著  

• Multifunctional chemical inhibitors of the florigen activation complex discovered by structure-based high-throughput screening

  Ken-ichiro Taoka, Ikumi Kawahara, Shoko Shinya, Ken-ichi Harada, Eiki Yamashita, Zenpei Shimatani, … 全著者表示

  Plant J   112 ( 6 )   1337 - 1349   2022年12月  [査読有り]

  DOI Web of Science PubMed

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  担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   共著  

• 19F chemical library and 19F-NMR for a weakly bound complex structure

  Shoko Shinya, Ritsuko Katahira, Kyoko Furuita, Toshihiko Sugiki, Young-Ho Lee, Yoshikazu Hattori, K … 全著者表示

  RSC Medicinal Chemistry   13 ( 9 )   1100 - 1111   2022年7月  [査読有り]  [招待有り]

  DOI Web of Science PubMed CiNii Research

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  担当区分：最終著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Royal Society of Chemistry (RSC)   単著  

  <jats:p>
  <jats:sup>19</jats:sup>F-NMR analysis using the optimized <jats:sup>19</jats:sup>F chemical library enables the modeling of the structure of the weakly bound protein–compound complex, overcoming the difficulty in fragment-based drug discovery.</jats:p>

• Cooperative regulation of PBI1 and MAPKs controls WRKY45 transcription factor in rice immunity

  Ichimaru Kota, Yamaguchi Koji, Harada Kenichi, Nishio Yusaku, Hori Momoka, Ishikawa Kazuya, Inoue H … 全著者表示

  NATURE COMMUNICATIONS   13 ( 1 )   2397   2022年5月  [査読有り]

  DOI Web of Science PubMed CiNii Research

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  担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC   共著  

  <jats:title>Abstract</jats:title><jats:p>The U-box type ubiquitin ligase PUB44 positively regulates pattern-triggered immunity in rice. Here, we identify PBI1, a protein that interacts with PUB44. Crystal structure analysis indicates that PBI1 forms a four-helix bundle structure. PBI1 also interacts with WRKY45, a master transcriptional activator of rice immunity, and negatively regulates its activity. PBI1 is degraded upon perception of chitin, and this is suppressed by silencing of <jats:italic>PUB44</jats:italic> or expression of <jats:italic>XopP</jats:italic>, indicating that PBI1 degradation depends on PUB44. These data suggest that PBI1 suppresses WRKY45 activity when cells are in an unelicited state, and during chitin signaling, PUB44-mediated degradation of PBI1 leads to activation of WRKY45. In addition, chitin-induced MAP kinase activation is required for WRKY45 activation and PBI1 degradation. These results demonstrate that chitin-induced activation of WRKY45 is regulated by the cooperation between MAP kinase-mediated phosphorylation and PUB44-mediated PBI1 degradation.</jats:p>

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総説・解説記事等 【 表示 ／ 非表示 】

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• オルガネラ間コンタクトを担うVAP蛋白質の構造と機能

  古板恭子, 児嶋長次郎

  酵素工学ニュース   Vol.81   12 - 16   2019年4月

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  記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（大学・研究所紀要）   共著  

• Amino Acid Selective 13C Labeling and 13C Scrambling Profile Analysis of Protein α and Side-Chain Carbons in Escherichia coli Utilized for Protein Nuclear Magnetic Resonance

  Toshihiko Sugiki and Kyoko Furuita and Toshimichi Fujiwara and Chojiro Kojima

  Biochemistry   57 ( 26 )   3576 - 3589   2018年7月

  DOI

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  記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society ({ACS})   単著  

• Current NMR Techniques for Structure-Based Drug Discovery

  Toshihiko Sugiki, Kyoko Furuita, Toshimichi Fujiwara, and Chojiro Kojima

  Molecules   23 ( 1 )   148   2018年1月  [査読有り]  [依頼有り]

  DOI

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  記述言語：英語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）   共著  

• Protein 19F-labeling using transglutaminase for the NMR study of intermolecular interactions

  Yoshikazu Hattori and David Heidenreich and Yuki Ono and Toshihiko Sugiki and Kei-ichi Yokoyama and … 全著者表示

  Journal of Biomolecular NMR   68 ( 4 )   271 - 279   2017年8月

  DOI

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  記述言語：その他外国語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（大学・研究所紀要）   出版者・発行元：Springer Science and Business Media {LLC}   単著  

• リジン残基13Cメチル化NMR法による相互作用解析と構造変化の検出

  服部良一, 児嶋長次郎

  生物物理   56 ( 5 )   288 - 289   2016年9月  [査読有り]  [依頼有り]

  DOI

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  記述言語：日本語   掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）   出版者・発行元：一般社団法人 日本生物物理学会   共著  

  その他リンク： https://www.jstage.jst.go.jp/article/biophys/56/5/56_288/_article/-char/ja/

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研究発表 【 表示 ／ 非表示 】

研究発表 【 表示 ／ 非表示 】

• 植物構造生物学研究と創薬

  児嶋長次郎  [招待有り]

  植物科学シンポジウム2018 

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  開催年月日： 2018年12月

  記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

  児嶋長次郎, “植物構造生物学研究と創薬”, 植物科学シンポジウム2018, Dec. 2018 (招待講演).
  https://bsw3.naist.jp/hashimoto/?page=1398
  

• NMR tools developed for protein-drug and protein-protein interaction studies

  C. Kojima  [招待有り]

  The 6th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR 

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  開催年月日： 2018年11月

  記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

  C. Kojima, “NMR tools developed for protein-drug and protein-protein interaction studies”, The 6th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR, Nov. 2018 (Invited Lecture).
  http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/ynmr/workshop.html
  

学会誌・論文誌編集等 【 表示 ／ 非表示 】

学会誌・論文誌編集等 【 表示 ／ 非表示 】

• Molecules

  Section Editorial Board for 'Analytical Chemistry' 

  2017年11月

  -

  2019月10日

   

• Molecules

  Guest Editor 

  2016年

  -

  2018年

   

共同・受託研究情報 【 表示 ／ 非表示 】

共同・受託研究情報 【 表示 ／ 非表示 】

• 低分子化合物ライブラリーを用いたフッ素NMRスクリーニング

  企業等からの受託研究  

  研究期間： 2015年11月  -  2016年9月 

担当授業科目（学内） 【 表示 ／ 非表示 】

担当授業科目（学内） 【 表示 ／ 非表示 】

• 2025年度   生命機能構造解析学

  大学院理工学府

• 2025年度   構造生物学

  大学院理工学府

• 2025年度   科学技術史

  教養教育科目

• 2025年度   化学の世界Ｄ(生命の化学)

  教養教育科目

• 2025年度   化学の世界Ｃ(環境の化学)

  教養教育科目

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教育活動に関する受賞 【 表示 ／ 非表示 】

教育活動に関する受賞 【 表示 ／ 非表示 】

• 2017 春学期 Good Lecture（物理化学Ⅰ）

  2017年   横浜国立大学  

  受賞者（グループ）： 児嶋長次郎

• 2016 秋学期 Good Lecture（構造生命化学）

  2017年   横浜国立大学  

  受賞者（グループ）： 児嶋長次郎、川村出

その他教育活動及び特記事項 【 表示 ／ 非表示 】

その他教育活動及び特記事項 【 表示 ／ 非表示 】

• 2018年10月

  　

  　

  “NMRを用いた開花機構の解明とその制御”   (学生の学会賞等の受賞実績)

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  中村歩美, ポスター賞（植物新種誕生の原理 若手の会）, “NMRを用いた開花機構の解明とその制御”, 2018年10月30日

委員歴 【 表示 ／ 非表示 】

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• 日本生物物理学会

  2017年04月 - 2019年3月  代議員

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  委員区分：その他 

• 日本蛋白質科学会

  2015年06月 - 2019年6月  役員（選管、渉外）

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  委員区分：その他 

• 日本核磁気共鳴学会

  2012年04月 - 2018年3月  評議員

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  委員区分：その他 

学内活動 【 表示 ／ 非表示 】

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